Estudio de la contribución polar, no polar y electrostática a la estabilidad estructural de la subunidad b de la ATP sintasa mediante simulaciones computacionales

Abstract

La ATP sintasa en un complejo de múltiples proteínas o subunidades que se acoplan para catalizar la síntesis de ATP. Dicho proceso es fundamental para la mayoría de las reacciones celulares, por lo que existe una gran cantidad de investigaciones enfocadas en elucidar y comprender los detalles del mecanismo catalítico. Se sabe que este mecanismo depende de la cooperación de todas las subunidades de la ATP sintasa, las cuales cambian constantemente y transmiten sus impulsos entre sí, como si se tratara de una maquinaria molecular. Esta dinámica implica que se debe cumplir un compromiso entre la flexibilidad funcional y la estabilidad estructural de estas proteínas para que se lleve a cabo la catálisis. En esta disertación de tesis se investigó la subunidad b aislada de la bacteria termófila Bacillus PS3 (Tb) que es donde se localiza el sitio catalítico de la enzima. Esta subunidad es de interés debido a que mantiene su naturaleza estructural similar a la que se encuentra en el complejo ATP sintasa, por lo que es un buen modelo para estudiar su flexibilidad y estabilidad. En este estudio fue posible determinar el mecanismo de estabilización de Tb y su relación con el comportamiento conformacional necesario para su actividad biológica, utilizando simulaciones computacionales y análisis experimentales.